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小米手机短信自动弹出可能有以下几种原因。
1、短信权限设置异常：应用程序权限管理可能出现问题，导致短信功能异常，您可以尝试在设置中检查短信应用的权限，确保它在后台运行和显示通知的权限被允许。
2、短信通知服务异常：可能是短信通知服务出现问题，您可以尝试在设置中关闭短信通知功能，然后重新打开，看是否能恢复正常。
3、系统卡顿或内存不足：手机系统卡顿或内存不足也可能导致短信自动弹出，您可以尝试清理手机缓存，关闭不必要的后台应用，或者重启手机。
4、应用软件冲突：某些第三方应用可能与系统冲突，导致短信功能异常，您可以尝试卸载最近安装的应用，或者备份重要数据后恢复出厂设置。
5、手机中毒或恶意软件：手机中毒或恶意软件也可能导致短信自动弹出，您可以尝试使用安全软件进行扫描和清理。
如果以上方法都不能解决问题，建议您联系小米的官方客服或者到附近的售后服务中心进行检查和维修。